
近日,,,63岁的陈伯到医院复查身体,,报告显示其骨髓形态学检测到7.0%的原始细胞,,,流式检测也发现了8.1%的MRD细胞,,这不免让人担心是否疾病复发????然而,,TP53基因的一代测序结果却是阴性,,,,这让情况变得更为复杂。。。
基因筛查结果与诊断相冲突??
NGS检测还原“真相”
回顾陈伯的病史,,,,去年他被诊断为骨髓增生异常综合征(MDS),,,当时通过NGS检测到了TP53 p.F270S基因突变,,,,变异等位基因频率(VAF)为28.65%。。。
今年3月复查时,,,各项检查结果看起来并没有明显的异常。。。但最近复查的骨髓形态和流式检查结果提示疾病复发,,,基因检测结果却是阴性。。达粤精准医学中心为了进一步确认,,加做了“TP53基因突变检测(NGS)”,,,结果再次检测到了TP53 p.F270S基因突变,,,,但突变频率降为9.22%。。

一代测序检测结果

NGS检测结果
同样,,36岁的患者李娟也遇到了类似的情况。。。她因为身体不适而就医,,血常规显示血小板显著增多,,,,骨髓活检结果考虑可能是骨髓增殖性肿瘤(原发性血小板增多症,,,,ET)。。但MPN热点基因突变的qPCR筛查结果却是阴性,,,这让诊断陷入了困境。。。。
幸运的是,,,达粤精准医学中心通过NGS检测,,发现了CALR p.E371Rfs*47的基因突变,,,从而支持了ET的诊断。。。

这两个案例都展示了二代测序(NGS)在临床诊断上的重要优势。。。相比于一代测序和qPCR,,,NGS具有更高的灵敏度和通量,,,能够更准确地检测出低频突变,,,,为疾病的诊断、、预后评估和用药指导提供更加可靠的信息。。

达粤血液肿瘤检测全面升级
“一代”转“二代”优势显著
1、、、、高灵敏度
一代测序法的测序原理导致其检测灵敏度较低(10%~15%),,无法检测低频突变,,,对于突变比例低于10%~15%的肿瘤标本,,,,采用一代测序法检测可能出现假阴性。。。。
二代测序(NGS)方法则可通过增加测序深度提高其检测灵敏度(10-2~10-6),,,,可准确检测低频突变,,适用于血液肿瘤微小残留病(MRD)和复发监测。。。
一代测序灵敏度测试
标本1:突变频率12.69%

标本2:突变频率8.92%

标本3:突变频率5.07%

注:一代测序无法检出低频突变,,同步进行的二代测序能稳定检出。。。
2、、、、定量检测
从一代测序获得的测序峰图中,,,,只能定性判读样本中是否携带某个突变,,,无法评估突变频率,,难以对肿瘤突变负荷进行评价。。
二代测序能够基于测序Reads数对基因突变频率(VAF)进行定量测定,,,,辅助临床准确评估肿瘤突变负荷和预后。。。。

达粤血液肿瘤基因检测
赋能临床全周期精准诊疗
1、、辅助诊断
血液肿瘤目前主要采用WHO提出的MICM分型标准,,,,分子生物学检测结果是疾病诊断的重要依据。。。
如JAK2/CALR/MPL基因是BCR/ABL1阴性MPN的主要诊断标准之一,,,,SF3B1突变存在于约80%的MDS-RS患者,,,MYD88突变可见于约90% LPL/WM,,,可辅助疾病的精准诊断。。
2、、预后评估
基因突变检测可辅助是各类血液肿瘤的预后判断,,NCCN指南提出了基于基因突变的AML预后分层体系,,,,如CEBPA-bZIP、、、NPM1基因突变与预后良好相关,,在CLL/SLL中TP53基因突变提示预后不良,,其他多种血液肿瘤也已证实了一些具有明确预后意义的突变基因。。。
3、、用药指导
基因突变检测可为靶向药物提供分子治疗靶点,,,FLT3、、、、IDH1/2和BRAF等突变基因已有靶向药物上市。。。。
此外,,基因突变可提示药物的敏感或耐药性,,,,例如MYD88 /CXCR4基因突变可影响伊布替尼在LPL/WM中的疗效,,ABL1激酶区突变是CML TKI耐受的主要机制之一。。。。
4、、、、MRD监测
基因突变是血液肿瘤MRD监测的分子标志物之一,,,NGS技术的检测灵敏度可随测序深度加深进一步提高,,,在MRD监测方面具有很大的优势,,,且NGS能够同时检测多个突变位点,,可以监测克隆演变。。。
达粤近期全面升级了血液肿瘤基因检测NGS项目,,,,旨在精准响应临床对血液肿瘤诊疗的多样化需求,,,,覆盖血液肿瘤诊断分型、、、预后评估、、、、精准治疗和MRD监测相关的热点基因。。。。
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